云水谣剧情讲述一个是台大医学系高材生陈秋水，一个是逃婚的富家小姐王碧云，一次不经意的邂逅注定了二人要纠缠一辈子的缘分。而命运却总喜欢做个见不得美满的坏人,硬生生的将二人分隔两地。在二人苦苦追寻彼此的同时，秋水又遇上了另一个“碧云”。若干年后，相隔了大半个中国的秋水和碧云再次相遇，两个碧云与他(她)们之间至死不渝的爱情将会以怎么样结果终结呢?
19世纪40年代的台湾，王家千金王碧云从教堂逃婚出来，坐上了勤工俭学的医学院穷学生陈秋水的黄包车。一段意外的邂逅，让两人从互生暗恋到心心相印。然而陈秋水为躲避迫害从台湾来到大陆，自此两个相爱的人被分隔两岸，唯有坚守彼此的誓言思念对方。陈秋水在大陆以行医为生，无论在战地医院还是复员后在闽西农村，都不忘给碧云写信，一封封遥寄思念之情的信石沉大海;碧云在台湾以儿媳身份担负起照顾婆母和带大两人女儿陈瑞的重任艰难度日。
时间到了80年代，王碧云带着女儿踏上了寻找陈秋水的路途。在闽西的医院里，终于见到了在外出诊遭遇泥石流而重伤的陈秋水，昏迷中的陈秋水嘴里一直喃喃着“碧云”，碧云紧握着陈秋水的手，当陈秋水睁开双眼时，恍惚中看到了碧云年轻时候的模样。
