南风知我意剧情讲述傅云深是非常有名的植物学家，朱旧是一位无国界医生，两人为了寻找一种要用植物，便利用去发达地区义务救援的机会，找到他们一直在找的可医用的植物。傅云深为了药品国进行研究，回到国家之后才发现自己同父异母的弟弟傅西州为了能够得到更多的利益将医用植物用在化妆品里卖出去。
傅云深因一场车祸受重伤，而他一直研制的药品也停了下来，此时朱旧得知医用植物被用在化妆品之后，但他并不知道是傅西州搞的鬼，因此对傅云深有了很深的误会。
经过半年，朱旧得知实情，与傅云深重新和好，并即将结婚，也就是在这时候朱旧突然发现自己父母死因真相的线索，她父母的死因和傅云深的父母有着很大的关系，这让他们的关系再次陷入僵局。傅云深并未放弃对朱旧的感情，依旧始终如一，而傅云深与傅西州之间的对弈也结束，两人重新成为兄弟，而朱旧也放下心中芥蒂与傅云深重新在一起，两人的幸福从此开始。
