龙虎5世剧情讲述了2023年11月初，美国休斯教、德国慕尼黑和朝鲜平壤接连受到神秘组织的突然攻击，导致大规模核爆炸，整个世界都处于灾难之中。直到2028年，核爆炸产生的辐射才有所衰减。
地球上在世界浩劫中幸存的只有南沙群岛中的斯特兰岛，岛上生存着来自世界各地的220万人，其中主要是中国人，部分东南亚人，部分曰本人韩国人，还有来这里度假的欧美人。随着岛外核辐射逐渐衰减，军队组织特别行动组开始了小规模的对外搜救幸存者的行动。
然而灾难再次降临，搜救活动中获救的一名幸存者身上存在着一种致命病毒，将整个岛屿再次推向危机。
