球状闪电剧情讲述讲述主人公刘祠目睹父母死于球状闪电发誓破解谜团，随后与恐怖分子斗争，解开球状闪电真相，与所爱之人得以重见的故事。
从小被外太空势力“观察者”劫持、目睹母亲惨遭不测的少校林云，带着冰冷而神秘面纱回到地球，就职于军方下属的新概念武器研发公司，欲图通过研发新概念武器预防和抵制“观察者”对地球的掠夺，歼灭被观察者控制的犯罪团伙伊甸园。怪咖博士陈陈因父母意外离世，陷入对球状闪电的疯狂研究。在一次打击伊甸园的行动中林云意外见识了球状闪电的威力，将陈陈的研究纳入新概念武器研发重点。此后他们组成球状闪电专项组，开启了对球状闪电的一系列探索研究。
随着研究的深入和推进大家也不断遭到恶势力的破坏威胁，但林云仍无畏无惧，带领专项组攻难克艰，终于破解了球状闪电的秘密。当外星观察者来临，林云利用球状闪电引发的核聚变彻底捣毁了观察者的计划，与其同归于尽，成为量子态。望着天边升起的一颗蓝太阳，陈陈终于理解了林云的冷漠和坚毅。
