圣地可可西里剧情以上世纪初可可西里地区汉藏人民联合保护藏羚羊的史实为背景，讲述几个部落几代人保护藏羚羊的故事。
英国商人威廉为了获取藏羚羊绒，秘密潜入可可西里腹地的卓康甲都部落。这里是藏羚羊的自由天堂，更是屠猎者梦寐以求的黄金圣地。忠心守护藏羚羊的土司府在多金寨的阴谋下，陷入家族争斗的漩涡，藏羚羊的生命受到了威胁。多吉临危受命为新土司，他爱上了死对头的女儿央金，二人坚守初心暗中扶持，共同摧毁了威廉与次仁秘密打造的羊绒走私基地。次仁见阴谋败露，不惜联手外敌大举入侵卓康甲都。在危难关口，卓康甲都的各族百姓们齐心协力，以少胜多扭转了局面。战后，多吉成为人人敬仰的好土司，他带领自己的族人远离杀戮，开始了守护藏羚羊的新生活。
