上海某旅馆，一批中国专家齐聚一堂，商议如何调查日军在中国使用生化武器，此时门外忽然有人敲门，一名中国专家起身刚刚打开房门便遭到了不明人士的毒手，其它几名中国专家见状想起身逃跑，屋外冲入一名蒙面女子，二话不说掏枪杀死了所有中国专家。
事后李克明与樊露谈论中国专家被暗杀的事情，李克明指出中国专家来上海的事情非常隐秘，一般人根本不知道这件事情，因此可以断定已方出现内鬼，说完话李克明指出中国专家里面只有一个人逃出来，此人名叫罗森。
两人谈话的时候，茜茜从外面走了进来，一进屋就半开玩笑指出李樊二人在约会，李克明闻言也是半开玩笑，承认自己是跟樊露在约会，同时也确实是在谈论工作，樊露一见李克明如此说话，心中生气之下转身走出办公室。
茜茜见樊露离去，立即一本正经询问李克明之前与樊露谈了什么，李克明便将之前说的话一五一十重新说了一遍，最后命令茜茜去寻找罗林。
罗森在一家旅馆住下之后，一名伙伴拿来一张报纸，上面正是中国专家被暗杀的新闻，看着新闻，罗森心有余悸，指出如今不能回出国，只能去重庆，伙伴闻言建议罗森投靠CPA组织，罗森却没有赞成伙伴的建议，当场指出CPA的人也不可信，说话间茜茜从外面走了进来，一见屋便询问谁是罗森，罗森闻言生怕茜茜是敌人，站在当场没有透露身份，此时屋外忽然有人扔入一枚炸弹，茜茜见状立即冲出屋外，刚刚趴到地上，炸弹轰然爆炸。
事后茜茜领着罗森回总部，不料罗森怀疑茜茜是敌方人员，趁着茜茜不防备的时候转身就逃，茜茜本来想追过去，奈何不远处有二名警察，无奈之下茜茜只得放弃了罗森。
茜茜回到总部将事情经过告诉给了李克明，李克明则派人将暗杀中国专家的女杀手抓到总部审讯，经过审讯，女杀手仅是透露自己名叫朱丽，但是却没有承认是自己杀伤中国专家。
李克明与村正在安全屋见面，在见面过程中，村正透露出已故岩井生前进行过一项日本特工冬眠计划，李克明听到这个计划大吃一惊，此时有手下人来报有警察上门，李克明迅速带领村正撤退，打算去法国租界避难，不料在路上遇到一伙身份不明的枪手，当场杀死了村正。
事后李克明回到总部，替茜茜包扎伤口，多亏之前茜茜赶来支援，不然李克明很有可能落得跟村正一样的下场，替茜茜包扎完伤口之后，李克明来到办公室，向樊露透露日本特工冬眠计划，同时将怀疑对象移到了茜茜身上，认为茜茜便是冬眠计划中的一员。
虽然李克明在樊露面前怀疑茜茜是敌方特工，暗地里却让茜茜诈死合骗过朱丽，
茜茜一死，李克明让朱丽护送罗森回重庆，朱丽信为为真，临行之前想杀死罗森，被樊露与茜茜当场杀死，事后两姐妹回到总部，获得了李克明的表扬。
茜茜一直在打探马源的踪迹，马源却是一直不肯现身，不得已之下，茜茜叮嘱同伙继续监视马源的未婚妻秦小惠。
与此同时，樊露负责寻找一名日军生化武器袭击幸存者，这名幸存者被安置在圣马利医院里面，樊露与一名苏菲还没走进医院里面，忽然发现医院的走道上有几个可疑怀子，立时间，樊露升起警觉将苏菲拉到一边，苏菲却是不明真相，询问樊露为何停止前进，樊露闻言让苏菲往走道上看，待苏菲看见几个在走道上东张西望的男人之后，樊露指出几个男人全部是日军派来的奸细，就是等着CPA的人送上门。
茜茜经过跟踪调查，终于发现了马源，此时马源根本不知道被人跟踪，悄悄租了一间旅馆与妻子相见，妻子一进屋立即抱住马源紧紧不放，随后询问马源为何一直不回家，马源闻言面露难色，正想对妻子说话的时候，茜茜出现在门口，当场表示马源要与自己有事情要办，所以不能跟秦小惠回家。
秦小惠并不认识茜茜，好奇之下询问茜茜是谁，茜茜闻言透露自己与马源是同学，随后将马源唤到屋外谈话，马源请求茜茜放过自己，茜茜却指出马源已经被值入病毒，因此必须要跟自己合作。
苏菲带着樊露来找一名日本人，刚好要找的日本人就站在门外，看着高大强壮的日本人，樊露站在原地不肯上前，苏菲却是毫无惧色来到日本人面前问话，不料刚刚开口立即被日本人扔到了水泥地上，看着苏菲痛苦万分的模样，樊露打了退堂鼓，指出自己没必要再去找人。
茜茜回到日军总部查找一些资料，在查找过程中被几名日本士兵发现，日本士兵将情况告诉给了北野，北野恢复日本士兵将茜茜领进一间办公室关押，茜茜进屋后喝问日本士兵为何关押自己，日本士兵指出是受到北野的命令，茜茜闻言无话可说，只得待在了办公室中。
在办公室待了一阵，茜茜开始不麻烦，拍打房门将一名日本士兵唤进屋中，待日本士兵进来，茜茜指出办公室无房无水，北野到底什么时候才放自己走，日本士兵闻言透露北野正在楼下开新闻发布会，只要茜茜不下楼，随便去哪间办公室休息都可以，说完话日本士兵走出房间。
李克明混在众记者当中倾听北野演讲，此时忽然响起敲击水管的声音，该声音正是茜茜向李克明传递一些秘密内容的方式，听着连续不停的敲击声，李克明终于知道苏菲是日本人派来的敢死队，体内藏有活动细菌病毒。
离开日军总部之后，李克明将事情经过告诉给了樊露，两人找到苏菲拆穿了苏菲的身份。完成任务之后，李克明与桂海清会面，除了桂海清以外，还有一位名叫霍华德的美国人，霍华德与李克明老相识，请求李克明协助美国阻止日本人研究空飘炸弹计划。（剧情百科原创剧情，转载请注明出处！）
