蒋介石担任国民军军事总监后，发现黄埔军校内共产党员占了绝大多数，便发动清洗行动，秘密逮捕黄埔军校的共产党员。毛泽东找到共产国际副代表季山嘉，毛泽东建议马上联系各军做好战备，随时开赴广州平叛。
一九二六年三月二十日，蒋介石发动中山舰事件，由于苏联顾问团和中共中央的妥协退让，以周恩来为首的全体共产党员被迫退出黄埔军校和国民革命第一军。
在中共中央召开关于整理党务案的谈论案上，毛泽东拒绝签字，并顶撞了中央特派员张国焘，受到党纪处分。由于中共中央的妥协，整理党务案顺利通过。
