韦小宝夜潜顺治的山洞内，说服顺治暂时躲避喇嘛，却被玉林赶来阻止。巴颜又率喇嘛折返清凉寺，幸少林寺四大金刚及十八罗汉赶至，将他们击退。顺治交给韦小宝一本四十二章经，着其转交康熙，并要他谨记“永不加赋”四字。小宝与双儿下山时遇到神龙岛胖头陀，韦小宝被擒及被迫交出经书，幸四大金刚及众罗汉相救，并沿途护送返京。
韦小宝将顺治的四十二章经收藏在京城一客栈内，又带双儿游市集，却误上了胖头陀安排的“贼车”被拉往郊外。韦小宝与方怡重遇，方怡态度异常变化，让韦小宝摸不清头脑，方怡谓称沐剑屏正在“神仙岛”等候韦小宝，韦小宝不虞有诈答允一同前去接沐剑屏。
韦小宝乘船和方怡来至“神仙岛”，却误被蛇咬，幸蒙陆高轩所救。
方怡把韦小宝骗上岛，洪夫人并不守约把解药给于方怡和沐剑屏，方怡才知自己中了圈套，暗骂自已骗小宝。
神龙大殿上，陆高轩、胖头陀带着韦小宝见过了教主夫人苏荃，韦小宝的花言巧语惹得洪夫人开心逃过了一劫。也得悉神龙教派人假扮太后潜服宫中十多年，企图盗取大清命脉藏宝图。教主夫人苏荃为四十二章经一事要赐死锺志灵，志灵反抗，正碰灵蛇吐雾，众人顷刻纷纷倒下。陆高轩指使韦小宝杀死洪安通与洪夫人苏荃，却被人群中的沐剑屏制止。小宝才得知沐剑屏中了洪教主的毒，只有教主才能解得开，韦小宝劝说神龙教合解，立此大功，洪教主封韦小宝为新的白龙使，并传授他六式武功防身，小宝答应设法带方怡、沐剑屏离开，遂自告奋勇为洪安通找经书，却未料苏荃只派陆高轩及胖头陀随行。
韦小宝神龙岛重遇双儿，带着洪教主交给他的任务离开神龙岛，前往京城。
京城内，韦小宝将陆高轩瘦头陀二人和双儿分别安顿，自行入宫，向康熙汇报一切，遇建宁闯入要康熙和她比武，康熙妄称韦小宝是自己的徒儿，建宁公主要韦小宝陪她一起玩。
建宁公主无理取闹，令到宫女及侍卫退避叁舍，对韦小宝一顿拳打脚踢，强迫韦小宝一起玩，且烧了韦小宝的辫子，小宝气愤之下痛打建宁，但建宁非但不怕反而欢喜，原来她有被虐狂。康熙看到韦小宝被建宁打得遍体鳞伤，有些内疚。
次日，韦小宝又来到建宁寝宫，享受建宁的服侍，做起了桂贝勒。正好让赶来的太后撞个正着，太后看到自己要追杀的人在自己女儿被窝中，气愤之极，要杀韦小宝出气，危急时刻，韦小宝的白龙令掉在地上，太后发现韦小宝正在神龙教的新任白龙使，立刻俯首听命。
康熙连升韦小宝品级，是要派韦小宝上少林寺当和尚，韦小宝烦恼也无济于事，只好乖乖地安排好陆高轩和胖头陀在京等待，带着双儿前往少林寺。途中，遇到王屋派偷袭军营，却被小宝用掷骰子制服，刺客中却有一位美貌姑娘柔让韦小宝顿生好感，特意放走各人，令曾柔对他生出爱慕之心，要求韦小宝把手中的掷子送她留作纪念。
韦小宝剃度为僧让双心伤心，韦小宝委托张康年把双儿安置在山下等他。韦小宝在少林寺度日如年，一日，韦小宝出寺闲逛，竟碰到天下美女阿珂和阿琪在水中嬉戏，韦小宝对阿珂的美貌迷惑，发誓要娶她为妻，韦小宝从阿珂和阿琪的谈话中得知她们是要找她们的师父，扮做小神仙给阿珂姐妹占起卦来，韦小宝说出她们的去向，阿珂阿琪信以为真来少林寺找师父，却和少林寺小和尚净济打了起来，韦小宝也加入战团，无意之间抓了阿珂胸部一把，阿珂受辱割颈自刎。
