中田来到宫本被击中的现场，为宫本临死前嘴里的秘密感到可惜。他告诉小野，活要见人，死要见尸。赵军等人对严达庆背后开黑枪的行径十分愤慨。程慈航醒来，莫采石长出一口气。戚承祖和戚晓芳在河边看到昏迷的刘振亮。原来刘振亮顺河而下漂到的戚家庄。父女将刘振亮救下。
欧阳倩悉心照料程慈航，对他倾诉衷肠。霍蜜儿火急火燎赶来，也要照顾程慈航。看着霍蜜儿的专注，欧阳倩意识到自己可能永远不能这样心无旁骛地去爱程慈航。她心乱如麻。霍蜜儿怒闯警局，在办公室枪击严达庆要为程慈航报仇。幸亏欧阳倩及时赶到，才阻止了事态恶化。
莫采石训斥了严达庆一通，想通过霍然之手把程慈航调离警厅，让他远离五九档案，并且极力促成程慈航和霍蜜儿的婚事。程慈航不想调到中央警校去，当面驳回了莫采石的建议。霍蜜儿兴冲冲地到医院来看望程慈航，程慈航责怪她不该用父亲霍然的关系让自己调职，霍蜜儿莫名其妙，根本没听说过此事。程慈航开始怀疑调职背后的隐情。刘振亮在戚玉芳的照料下，病情有所好转，渐渐恢复了神智。
莫太太责怪莫采石不该故意把程慈航推向霍蜜儿，忽略欧阳倩的感受。莫采石觉得欧阳倩心思太重，不适合程慈航。在警厅，莫采石点醒欧阳倩，程慈航和霍蜜儿才是门当户对的一对儿。戚承祖向马太太提议让程慈航回到锦线协助处理帮中事务，但马太太觉得程慈航幼时虽被锦线收养，毕竟离开日久，终究和锦线不是一路人。李丽兰听到二人对话浮想联翩，她也希望程慈航能重回锦线，帮马太太分忧，同时，程慈航也可以名正言顺地继续和欧阳倩在一起。李丽兰劝程慈航回到锦线，被程慈航严辞拒绝。程慈航不屑于江湖人士为伍。
霍蜜儿一个人在程慈航家收拾东西，发现莫采石送给程慈航的钟坏了，擅自把钟送到钟表行修理。钟表行老板在钟的底座发现了五九档案。莫采石召开新闻发布会，授予程慈航首都首席大侦探的称号，享有特殊办案的权力，撤销对严达庆的一切奖励。
莫采石回到程慈航家发现钟不见了，大惊失色。
钟表行老板通过关系，暗中将五九档案卖给小野。莫采石通过霍蜜儿得知了钟的下落，他匆匆赶到钟表行，却发现里面的人死于非命，五九档案不翼而飞。莫采石这下真的慌了，下令警厅全力追查五九档案。他不敢告诉程慈航，因为他相信程慈航可以百分百侦破此案，而这次丢失的，正是蒋介石交给他保管的真五九档案。欧阳倩去档案室盗看五九档案的最新侦查资料，险些被刘阿常发现。欧阳倩告诉李丽兰日本人拿到了五九档案，想借常熟的船运大王陈海的货物将五九档案偷运回国。程慈航急于出院去常熟查案，莫采石不许，欧阳倩趁机成功请缨。刘阿常打听到陈海的儿子陈如骏正在跟情人美晴约会，而美晴是财政部吴其祥的姨太太。莫采石计上心来。莫采石打通了吴其祥的电话，捅破了陈如骏和美晴的私情。
马太太和李丽兰前往常熟，争夺五九档案。
严达庆带吴其祥到常熟捉奸，被李丽兰撞见。李丽兰故意和吴其祥起纠纷，陈如骏见势不妙，立刻逃跑。美晴软言劝阻吴其祥别和李丽兰一般见识。刘阿常在和欧阳倩一起查陈海家底细的时候，发现欧阳倩有些心不在焉。
刘阿常怀疑欧阳倩有别的心思。关天平提醒程慈航警厅众人，包括莫采石在内纷纷赶赴常熟，撺掇他也去。程慈航把关天平支开，火速赶往常熟。
严达庆和吴其祥设计捉奸，故意放美晴去找陈如骏。莫采石得知程慈航偷偷去常熟查案，担心程慈航掉进自己的布局中，连忙派人拦截。程慈航在路上成功破解了莫采石设的障碍，顺利抵达常熟。程慈航找到欧阳倩，反被责怪对欧阳倩不够信任。马太太让欧阳倩立刻退出行动，让李丽兰接手。为了不让程慈航插手，欧阳倩向莫采石报告了程慈航的下落。程慈航被当地警察以莫须有的罪名逮捕了起来。严达庆和吴其祥谈捉奸后的利益分成，原来严达庆想拿到陈如骏的把柄威胁陈海。
陈如骏和美晴在屋内偷情，突然听到敲门声，两人顿时紧张起来。开门一看，却见是马太太。严达庆叫来了记者，吴其祥冲进房内，没想到床上躺着的不是美晴，而是李丽兰。方捷乔装成军统的将军，也带人冲了进来，解救了李丽兰。严达庆和吴其祥扑了个空，出了大丑。严达庆躲了起来逃避责任，吴其祥向莫采石告状，莫采石分析，所谓的军统将军是假冒的。为了感激马太太，陈如骏查到了一艘名为青丸号的货船近日出港，上面有日本人的货物。陈如骏通知青丸号立即返回。程慈航成功越狱，给霍然打电话，霍蜜儿知道后迫不及待去常熟。
程慈航告诉千里外赶来的霍蜜儿，他回南京后会和欧阳倩成婚。
马太太截了青丸号上的五九档案，运往青浦。路上遇到日本人的拦截。欧阳倩殊死保护五九档案。众人打开匣子一看，却是一份假的五九档案。江湖上又掀起了一场新的杀戮。原来，真正的五九档案已被莫采石换走。事后，知晓内情的人士被莫采石通通灭口。
程慈航和霍蜜儿在酒店等欧阳倩回来。不料，等到的却是方捷和欧阳倩。欧阳倩告诉程慈航，自己一直在骗他，方捷才是她真正的男朋友。程慈航不相信这一切，想继续追问欧阳倩。锦线中人一拥而上，痛打了程慈航一顿。程慈航心如刀割。莫采石带着真正的五九档案回南京，他惴惴不安地寻思一个更安全的地方来放置。
李丽兰和齐掌柜回到锦线的堂口，发现堂口已被江湖中人占领，锦线中人死伤无数。
严达庆向莫采石汇报锦线堂口遇袭，江湖传言五九档案在锦线手中。程慈航申请全力追剿锦线。锦线弟子纷纷被逮捕。哈金斯向李丽兰买五九档案，李丽兰告诉他铁匣子在中央储备银行。哈金斯费了九牛二虎之力拿到了铁匣子，不料却是假的。哈金斯吃了亏，断绝了跟锦线的结盟关系，试图利用程慈航对锦线痛下杀手。一个包子铺的老板偶尔看到报纸上的新闻，忽然发现之前自己无意中从一个乞丐那里得到的铁匣子竟是无价之宝。
五九档案重现江湖，马太太决定重金去买。程慈航回忆过去的点滴，开始怀疑欧阳倩是锦线中人。程慈航得知马太太会在江流湾出现，立刻赶往江流湾。戚承祖在江流湾接应马太太，险些被警察逮捕。欧阳倩赶来，劝程慈航不要对锦线赶尽杀绝。程慈航希望在找到五九档案之前，将锦线中人控制起来，免遭江湖黑手的杀戮。欧阳倩通风报信，马太太和戚承祖成功逃走。
戚承祖痛恨程慈航不顾锦线的养育之恩，真是忘恩负义。马太太病情日重，锦线新的掌门人选成了她最大的心病。戚承祖坚持让程慈航回归锦线，只要他愿意回来，还可以把欧阳倩许配给他。程慈航和日本人双方都意识到还有一只铁匣子在江湖，希望就在它身上。宫本回来，让中田大感惊喜。宫本透露，救他的这家人很可能就有线索。程慈航质问欧阳倩两人关系为什么会变成现在这样，他想跟那个方捷谈一谈。欧阳倩变得那么冷淡，是否有人指使。欧阳倩狠心告诉程慈航，一切都晚了，她要嫁人了，她觉得程慈航跟霍蜜儿在一起才会幸福。欧阳倩独自一人回忆和程慈航的甜蜜时光，以及马太太的重托。她陷入两难的巨大痛苦。宫本偷偷关注戚承祖父女，发现二人正在往地窖藏铁匣子。戚承祖告诉女儿，必须保护好这个秘密。
程慈航不经意一句夸奖的话让霍蜜儿心花怒放。莫采石做工作，让程慈航忘掉欧阳倩，娶霍蜜儿。戚承祖找到警局，劝程慈航回归锦线主持大局，程慈航拒绝。莫采石告诫刘阿常一定要盯紧程慈航。李丽兰告诉欧阳倩，戚承祖已经去找程慈航摊牌。欧阳倩不抱希望。戚承祖再次找到程慈航家，告诉慈航他是锦线收养的孩子，为了更好的前途才托付给莫采石收养。程慈航答应从今天起决不再为难锦线。莫采石赶到，明确慈航不能和盗贼为伍，戚莫翻脸，莫采石拿枪指着戚承祖。程慈航推走戚承祖才化解了危机。
戚承祖和李丽兰碰面，对慈航不能回归忧心忡忡。暗处，刘阿常悄悄地跟了上来。
欧阳倩来找程慈航，看到自己送的昙花，心潮起伏。程慈航告诉欧阳倩，锦线的邀请让他很为难。欧阳倩心如刀绞，心疼慈航。戚承祖和围上来的刘阿常等警察大打出手。戚承祖发怒，要去找莫采石算账。正好遇上了程慈航和欧阳倩。欧阳倩装作不认识戚承祖。戚承祖不客气地勒令程慈航尽快回到锦线，程慈航走开。戚承祖给欧阳倩三天时间，做好程慈航的工作。莫采石承认是自己安排人做的，程慈航坚称不需要莫采石插手。如果戚承祖有三长两短，他只能以自己的命来谢罪了。
